Cubillas de Cerrato forma parte de la serie de asentamientos a lo largo del valle del arroyo de los Madrazo (Cubillas, Población, Alba, Vertavillo, Hérmedes), siguiendo el itinerario formado en la actualidad por las carreteras VA-101 y PP-1103, que discurren paralelas al arroyo. En el caso concreto de Cubillas, la carretera recorre la vertiente Sur del valle, situándose el pueblo al otro lado del arroyo. El espacio que queda entre el núcleo y el arroyo se corresponde con la zona de regadío, la más fértil, y que se está ocupando por construcciones de uso agrícola y ganadero